La UPFIM oferta programas educativos de posgrado, estudios orientados a la investigación y desarrollo tecnológico en el área agrícola, agroalimentaria y tecnología de los alimentos, para aquellos profesionistas que requieran profundizar en el conocimiento de su campo o disciplina: Maestría en Ciencias en Desarrollo Agrotecnológico Sustentable y Maestría en Ciencia y Tecnología de los Alimentos.